Theo cáo trạng, ngày 30/9/2010, Nguyễn Cự Tẩm được bổ nhiệm làm Tổng Giám đốc và là người đại diện theo pháp luật Công ty TNHH MTV Haprosimex (Công ty Haprosimex). Tháng 5/2013, ông Tẩm tiếp tục được bổ nhiệm chức danh Chủ tịch HĐTV kiêm Tổng Giám đốc Công ty Haprosimex. Trước đó, ngày 1/7/2010, Tẩm còn được bổ nhiệm kiêm nhiệm chức danh Giám đốc Nhà máy dệt kim Haprosimex. Quá trình làm Giám đốc Nhà máy dệt kim, ông ta đã có hành vi lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ.
Thời gian đương chức, Nguyễn Cự Tẩm nhiều lần chỉ đạo nhân viên lập chứng từ khống. Theo bản án, bị cáo này tự ra quyết định chi trả phụ cấp trái quy định cho bản thân hơn một tỷ đồng; cùng Phương còn lập khống chứng từ để thu khoản vay 600 triệu đồng; sai Phương tự hạch toán khoản lãi hơn 200 triệu đồng sau đó đòi thủ quỹ chi tiền... Nguyễn Cự Tẩm còn ép nhân viên chi tạm ứng cho mình hàng trăm triệu đồng. Khi cần hợp thức, ông ta chỉ đạo cấp dưới lập khống chứng từ thành chi tiếp khách của công ty.
Cuối năm 2017, Haprosimex phải tái cơ cấu, đồng thời chuyển loại hình hoạt động sang Công ty CP Tập đoàn Haprosimex. Hành vi của Nguyễn Cự Tẩm bị phát giác. HĐXX Bản án sơ thẩm nhận định, Nguyễn Cự Tẩm đã lợi dụng chức vụ, quyền hạn làm trái công vụ và trục lợi cá nhân hơn một tỷ đồng. Với số tiền hơn 300 triệu đồng chiếm đoạt từ khoản vay của công ty, tạm ứng cho cá nhân, Tòa xác định bị cáo đã tham ô.
Ngoài hành vi trên, quá trình điều tra, cơ quan điều tra đã tiến hành điều tra đối với một số hành vi có dấu hiệu sai phạm khác của Nguyễn Cự Tẩm. Tuy nhiên, do thời hạn điều tra đã hết, chưa đủ căn cứ kết luận nên cơ quan điều tra đã có Quyết định tách rút tài liệu để điều tra làm rõ xử lý sau đối với hành vi sử dụng không đúng mục đích số tiền 8 tỷ đồng đền bù giải phóng mặt bằng để xây dựng Nhà máy nước thải tại phường Phú Diễn (Bắc Từ Liêm, Hà Nội) của Công ty dệt kim Thăng Long (công ty con của Haprosimex); sử dụng số tiền 5,9 tỷ đồng bán vốn nhà nước tại CTCP Haprosimex Thăng Long; nhận hơn 2,4 tỷ đồng tiền tạm ứng tại Công ty Haprosimex để chi tiêu nhưng chưa có chứng từ hoàn ứng…
