Từ chiều 4/10 đến chiều 5/10, Binh chủng Hóa học đã huy động cán bộ, chiến sĩ cùng 10 xe đặc chủng (mỗi xe có dung tích 2.500 lít) để thực hiện tiêu tẩy toàn bộ khu vực hiện trường vụ cháy. Lực lượng phòng hóa đã sử dụng các loại hóa chất, vật liệu để cô lập, chống phát tán thủy ngân ra môi trường bên ngoài, đặc biệt là khu vực 2 nhà kho chứa bóng đèn huỳnh quang bị cháy.
Sau khi chống lan tỏa thủy ngân và hỗ trợ Công ty cổ phần Môi trường đô thị và công nghiệp 10 bốc xếp, cô lập nguồn ô nhiễm, lực lượng phòng hóa đã tiến hành tiêu tẩy toàn bộ hiện trường, trong đó bao gồm tường nhà, mái tôn, với tổng diện tích hơn 30.000m2.
Kể từ khi bắt đầu thực hiện nhiệm vụ xử lý, khắc phục hậu quả cháy ở Công ty Rạng Đông đến nay (từ ngày 12/9 đến ngày 5/10), Binh chủng Hóa học đã phối hợp với lực lượng của Bộ Tư lệnh Thủ đô Hà Nội thực hiện nhiệm vụ khắc phục ô nhiễm, quan trắc trinh sát môi trường cả ngày lẫn đêm. Lực lượng phòng hóa đã sử dụng 120.000 lít dung dịch và 4 tấn hóa chất chống lan tỏa, phát tán thủy ngân ra ngoài môi trường để làm sạch khu vực nhà xưởng.
Thượng tá Đậu Xuân Hoài, Phó Viện trưởng Viện Hóa học và Môi trường quân sự (Binh chủng Hóa học) cho biết, công tác bàn giao mặt bằng cho Công ty Rạng Đông sẽ được Binh chủng Hóa học thực hiện vào ngày 6/10.