Cấu trúc nhà thờ theo kiểu Roman, được bao bọc bởi hai dàn hợp xướng Gothic, thể hiện sự chuyển đổi phong cách từ Roman muộn sang Gothic sớm. Nhà thờ bao gồm một gian giữa theo kiểu Roman với phong cách thánh địa được bao bọc bởi hai dàn hợp xướng Gothic ở phía đông và phía tây.
Dàn hợp xướng phía tây với những bức tượng chân dung nổi tiếng của mười hai người sáng lập nhà thờ và bức bình phong phía tây là những kiệt tác nghệ thuật. Các phù điêu và tác phẩm điêu khắc đa sắc của dàn hợp xướng và bức bình phong được coi là một trong những tác phẩm điêu khắc quan trọng nhất của thời Trung cổ.
Nhà thờ được dựng lên với việc di dời tòa giám mục từ Zeitz vào năm 1028, bên cạnh một nhà thờ giáo xứ cũ. Do đó đây là nhà thờ chính tòa của Giáo phận Công giáo Naumburg-Zeitz. Với sự cải cách, nó đã trở thành một nhà thờ Tin Lành và hiện vẫn là một nhà thờ giáo xứ Tin Lành cho đến ngày nay.
Nhà thờ là một phần của Tuyến đường du lịch Roman ở bang Sachsen-Anhalt. Từ năm 1999, nhà thờ cùng cảnh quan của sông Saale và Unstrut- một khu vực quan trọng trong thời Trung cổ đã được đưa vào danh sách Di sản thế giới dự kiến của UNESCO tại Đức.
Nhà thờ Naumburg, là một minh chứng độc đáo cho nghệ thuật và kiến trúc thời Trung cổ. Năm 2018, Tổ chức Khoa học, Giáo dục và Văn hóa của Liên hợp quốc (UNESCO) đã công nhận nhà thờ chính tòa Naumburg là Di sản văn hóa thế giới.